Chrome浏览器本身并不具备完全自动整理书签目录的功能，但可以通过以下方法来有效管理和整理书签，使其更加有序：
1. 手动创建文件夹分类：打开Chrome浏览器，点击浏览器右上角的“三点”菜单，选择“书签”-“书签管理器”。在书签管理器中，可以点击左侧的“其他书签”或已有的文件夹，然后点击右键，选择“新建文件夹”。为新建的文件夹命名，例如可以按照工作、学习、娱乐等类别来划分。将书签拖拽到相应的文件夹中，进行分类整理。
2. 利用书签管理器排序和搜索：在书签管理器中，可以通过拖拽的方式调整书签的位置或文件夹的层级关系，使书签目录更加清晰。当书签数量较多时，可以使用搜索框，在众多书签中快速筛选出包含特定关键词的条目，方便查找和管理。
3. 安装书签管理扩展程序：Chrome浏览器支持多种书签管理扩展程序，这些扩展程序可以提供更强大的书签管理功能。例如，一些扩展程序可以自动将书签按照一定的规则进行分类，或者提供更便捷的书签编辑和搜索功能。可以在Chrome网上应用店中搜索并安装适合自己的书签管理扩展程序。
4. 定期清理无用书签：随着时间推移，一些曾经有用的网页可能已经失效或者不再具有参考价值。定期进入书签管理器，仔细检查每个书签的链接是否可用，删除那些不再需要的书签，避免书签列表变得臃肿杂乱，影响查找速度和使用体验。
5. 使用书签同步功能：如果在多台设备上使用Chrome浏览器，可以登录同一账号并开启同步功能。这样，在不同设备上对书签进行的整理和修改会同步更新，确保书签目录的一致性和完整性。